Chim cánh cụt Humboldt sống dọc theo bờ biển phía tây của Peru và Chile. Chúng được đặt tên theo dòng hải lưu lạnh Humboldt chảy từ Nam Cực đến xích đạo dọc theo bờ biển phía tây của Nam Mỹ.
Chúng là một trong 17 loài chim cánh cụt trên thế giới, tất cả đều sống ở bán cầu Nam.